Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL38Q2WGJ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms