Protein–RNA interactions for Protein: Q16890

TPD52L1, Tumor protein D53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L1Q16890 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPD52L1Q16890 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms