Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRNQ16849 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRNQ16849 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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