Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPP1Q16831 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPP1Q16831 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms