Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPROQ16827 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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