Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HIST2H2BEQ16778 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HIST2H2BEQ16778 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HIST2H2BEQ16778 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HIST2H2BEQ16778 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HIST2H2BEQ16778 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HIST2H2BEQ16778 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST2H2BEQ16778 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HIST2H2BEQ16778 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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HIST2H2BEQ16778 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST2H2BEQ16778 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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