Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPE65Q16518 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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RPE65Q16518 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPE65Q16518 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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