Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ATP6AP1Q15904 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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