Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms