Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIN2CQ14957 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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