Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMCO1Q147U7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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