Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC3Q14574 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms