Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BECN1Q14457 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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