Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSG2Q14126 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms