Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDE1CQ14123 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE1CQ14123 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms