Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CDK13Q14004 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
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