Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA9Q13797 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms