Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SHROOM2Q13796 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
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SHROOM2Q13796 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
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SHROOM2Q13796 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
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SHROOM2Q13796 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
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SHROOM2Q13796 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
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SHROOM2Q13796 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHROOM2Q13796 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
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