Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1SQ13698 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1SQ13698 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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