Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEUROD1Q13562 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEUROD1Q13562 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
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