Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXE3Q13461 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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