Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM28Q13263 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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