Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPA4Q13156 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPA4Q13156 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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