Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1AQ13111 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1AQ13111 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
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