Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GPS1Q13098 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPS1Q13098 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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