Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HSPB3Q12988 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSPB3Q12988 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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