Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP1Q12981 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BNIP1Q12981 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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