Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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RAB40BQ12829 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB40BQ12829 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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