Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EFEMP1Q12805 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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EFEMP1Q12805 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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EFEMP1Q12805 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EFEMP1Q12805 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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