Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TWF1Q12792 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TWF1Q12792 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TWF1Q12792 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TWF1Q12792 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TWF1Q12792 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms