Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 GCN4YEL009C 846 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 SAR1YPL218W 573 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 COS111YBR203W 2775 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 TRL1YJL087C 2484 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YCR043CYCR043C 384 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YFL063WYFL063W 456 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YAR029WYAR029W 225 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 HTB2YBL002W 396 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YNL114CYNL114C 372 nt2.33□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 COA4YLR218C 453 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 IRC8YJL051W 2469 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 RIM20YOR275C 1986 nt2.32□□□□□ -2.04 RIP-Chip
NOP56Q12460 FKS3YMR306W 5358 nt2.32□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 SWI6YLR182W 2412 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 TUS1YLR425W 3924 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YCR022CYCR022C 345 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.31□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 CDC60YPL160W 3273 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 PHO91YNR013C 2685 nt2.3□□□□□ -2.04 RIP-Chip
NOP56Q12460 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YDL062WYDL062W 426 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YGL149WYGL149W 306 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 RPL38YLR325C 237 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 NOP14YDL148C 2433 nt2.3□□□□□ -2.04 RIP-Chip
NOP56Q12460 YPR097WYPR097W 3222 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 SPP41YDR464W 4308 nt2.3□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 IRR1YIL026C 3453 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 HDA3YPR179C 1968 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 NOP53YPL146C 1368 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 NUT2YPR168W 474 nt2.29□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 SWI5YDR146C 2130 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YLR053CYLR053C 327 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 PXA2YKL188C 2562 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 YDR341CYDR341C 1824 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 VPS8YAL002W 3825 nt2.28□□□□□ -2.04
NOP56Q12460 RPH1YER169W 2391 nt2.28□□□□□ -2.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 MBB1YJL199C 327 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 UPS1YLR193C 528 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 CYB5YNL111C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 TOR2YKL203C 7425 nt2.27□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 SSD1YDR293C 3753 nt2.26□□□□□ -2.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 YDR048CYDR048C 315 nt2.26□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 YOR282WYOR282W 321 nt2.26□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 YOP1YPR028W 543 nt2.26□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 RTT101YJL047C 2529 nt2.26□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 TFC8YPL007C 1767 nt2.26□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PDR11YIL013C 4236 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 HTL1YCR020W-B 237 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 CYC7YEL039C 342 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PCC1YKR095W-A 267 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 RSE1YML049C 4086 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PET309YLR067C 2898 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 RTT107YHR154W 3213 nt2.25□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 NAM7YMR080C 2916 nt2.24□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 BRP1YGL007W 378 nt2.24□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 snR43snR43 209 nt2.24□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 SSQ1YLR369W 1974 nt2.23□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 SYH1YPL105C 2550 nt2.23□□□□□ -2.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 NPC2YDL046W 522 nt2.23□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 EMP24YGL200C 612 nt2.23□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 DNF1YER166W 4716 nt2.23□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PTP3YER075C 2787 nt2.23□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 SLY1YDR189W 2001 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 AGC1YPR021C 2709 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PDR1YGL013C 3207 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 MUK1YPL070W 1839 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 RPL37BYDR500C 267 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PAU18YLL064C 363 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PAU6YNR076W 363 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 NEO1YIL048W 3456 nt2.22□□□□□ -2.05
NOP56Q12460 PLC1YPL268W 2610 nt2.21□□□□□ -2.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 CFT2YLR115W 2580 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 JIP5YPR169W 1479 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 CHC1YGL206C 4962 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 YDR426CYDR426C 378 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 snR51snR51 107 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 RFX1YLR176C 2436 nt2.21□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 IST2YBR086C 2841 nt2.21□□□□□ -2.06 RIP-Chip
NOP56Q12460 UBP1YDL122W 2430 nt2.2□□□□□ -2.06 RIP-Chip
NOP56Q12460 SGS1YMR190C 4344 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 MCM22YJR135C 720 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 YCL046WYCL046W 324 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 SKP2YNL311C 2292 nt2.2□□□□□ -2.06
NOP56Q12460 DBP6YNR038W 1890 nt2.2□□□□□ -2.06
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