Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms