Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC15Q0P6D6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms