Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms