Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 AZF1YOR113W 2745 nt1.05□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 SPT7YBR081C 3999 nt1.05□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 UFD2YDL190C 2886 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 SIP4YJL089W 2490 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 RVS161YCR009C 798 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 YDL152WYDL152W 366 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 QCR7YDR529C 384 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 PRM8YGL053W 714 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 PAU18YLL064C 363 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 RPS18BYML026C 441 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 PAU6YNR076W 363 nt1.04□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 AHC1YOR023C 1701 nt1.03□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 RSM22YKL155C 1887 nt1.03□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 CDC36YDL165W 576 nt1.03□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 OCA6YDR067C 675 nt1.03□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 YKL044WYKL044W 321 nt1.03□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 YNL114CYNL114C 372 nt1.03□□□□□ -2.24
NIP7Q08962 ZRG17YNR039C 1818 nt1.03□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 HDA3YPR179C 1968 nt1.03□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 TTI1YKL033W 3117 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YKL123WYKL123W 381 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 RPL40BYKR094C 387 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 NOP15YNL110C 663 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YOR248WYOR248W 303 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 SVS1YPL163C 783 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 IRC16YPR038W 360 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YPR099CYPR099C 357 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 RAD50YNL250W 3939 nt1.02□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 MSN5YDR335W 3675 nt1.01□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.01□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YJR141WYJR141W 1044 nt1.01□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 RRT15YLR162W-A 189 nt1.01□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 TIM18YOR297C 579 nt1.01□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 SWI5YDR146C 2130 nt1.01□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 RAD9YDR217C 3930 nt1□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 SHE9YDR393W 1371 nt1□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 PAN3YKL025C 2040 nt1□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YDL016CYDL016C 303 nt1□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 SPR3YGR059W 1539 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 ZIP1YDR285W 2628 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YDL211CYDL211C 1119 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YGL217CYGL217C 342 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 RTT102YGR275W 474 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YOL159CYOL159C 516 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YBR071WYBR071W 636 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YPR039WYPR039W 336 nt0.99□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YLL054CYLL054C 2532 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 MET32YDR253C 576 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 PAU2YEL049W 363 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 CTK3YML112W 891 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 UBX4YMR067C 1251 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YBR032WYBR032W 303 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YPR063CYPR063C 423 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 SLX4YLR135W 2247 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 SGO1YOR073W 1773 nt0.98□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 SAC3YDR159W 3906 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 BUD3YCL014W 4911 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 MUK1YPL070W 1839 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 TOF2YKR010C 2316 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YDR509WYDR509W 348 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 ILM1YJR118C 612 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YSY6YBR162W-A 198 nt0.97□□□□□ -2.25
NIP7Q08962 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.96□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YDR029WYDR029W 315 nt0.96□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 RPL9BYNL067W 576 nt0.96□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YOP1YPR028W 543 nt0.96□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 SNU56YDR240C 1479 nt0.96□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 NUP188YML103C 4968 nt0.96□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 GDS1YOR355W 1569 nt0.96□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 VPS54YDR027C 2670 nt0.95□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 SRP14YDL092W 441 nt0.95□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.95□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YAR009CYAR009C 3591 nt0.94□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 snR84snR84 550 nt0.94□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YLL020CYLL020C 306 nt0.94□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YDR008CYDR008C 351 nt0.93□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 TMA22YJR014W 597 nt0.93□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 HCH1YNL281W 462 nt0.93□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 SEC3YER008C 4011 nt0.93□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 MKT1YNL085W 2493 nt0.92□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YGR283CYGR283C 1026 nt0.92□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YAP3YHL009C 993 nt0.92□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 UBP3YER151C 2739 nt0.91□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 NOC3YLR002C 1992 nt0.91□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.91□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 GAL7YBR018C 1101 nt0.91□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 MDS3YGL197W 4464 nt0.91□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 SWI4YER111C 3282 nt0.91□□□□□ -2.26
NIP7Q08962 PIG1YLR273C 1947 nt0.9□□□□□ -2.27
NIP7Q08962 YGR025WYGR025W 303 nt0.9□□□□□ -2.27
NIP7Q08962 APQ13YJL075C 417 nt0.9□□□□□ -2.27
NIP7Q08962 APL1YJR005W 2103 nt0.9□□□□□ -2.27
NIP7Q08962 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.9□□□□□ -2.27
NIP7Q08962 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 85.9 ms