Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSC1Q08554 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSC1Q08554 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms