Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4F3Q08477 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms