Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC3A1Q07837 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms