Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIGFQ07326 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PIGFQ07326 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PIGFQ07326 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms