Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL16A1Q07092 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL16A1Q07092 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COL16A1Q07092 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
COL16A1Q07092 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL16A1Q07092 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms