Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOX4Q06945 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX4Q06945 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms