Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBQ06643 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LTBQ06643 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LTBQ06643 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBQ06643 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBQ06643 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBQ06643 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms