Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms