Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUCB1Q02818 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms