Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF8Q02556 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms