Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
OC90Q02509 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OC90Q02509 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OC90Q02509 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OC90Q02509 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OC90Q02509 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms