Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPIBQ01892 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms