Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms