Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EXOSC10Q01780 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC10Q01780 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms