Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1DQ01668 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms